Ga Yên Viên là ga đầu mối đường sắt chính, gồm các tác nghiệp chính là đón - gửi, giải thể lập tàu khách và tàu hàng, tổ chức xếp dễ hàng hóa đi/đến pía Tây, Bắc, Tây - Bắc và Đông - Bắc thành phố Hà Nội. Hiện tại, bãi xếp dỡ container Yên Viên tác nghiệp trung bình 2 đoàn tàu/ngày-đêm, cơ sở hạ tầng chưa đủ khả năng đáp ứng về nhu cầu vận tải hàng hóa và các nhu cầu khác của hành khách.

Với Dự án Trung tâm Logistic - đường sắt Yên Viên, nhà đầu tư sẽ tiến hành đầu tư toàn bộ các hạng mục công trình để phục vụ cho việc bốc xếp, dỡ vận tải hàng hóa tại ga Yên Viên với tổng mức đầu tư 90 tỷ đồng, quy mô dự kiến khi hoàn thành và đưa vào khai thác từ tháng 6/2016 đạt sản lượng 1,2 - 1,8 triệu tấn/năm, tương đương với khoảng 120 - 150 container nặng và rỗng xếp dỡ tại bãi/ngày.

Từ việc thí điểm cho thuê bãi hàng tại ga Yên Viên, đây là bước khởi đầu để Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam mời gọi các doanh nghiệp có đủ năng lực và tiềm lực tài chính, cùng tương đồng về ngành nghề kinh doanh tham gia đầu tư, nâng cấp, hiện đại hóa kho bãi hàng tại các ga đường sắt.